As principais áreas de atuação de um Engenheiro Ambiental são:

- Sistemas, métodos e processos de aproveitamento, proteção, monitoramento, manejo, gestão, ordenamento, desenvolvimento e preservação dos recursos naturais;
- Recuperação de áreas degradadas, remediação e biorremediação de solos degradados e águas contaminadas e prevenção e recuperação de processos erosivos;
- Fontes tradicionais, alternativas e renováveis de energia relacionadas com Engenharia ambiental;
- Sistemas e métodos de conversão e conservação de energia, e impactos energéticos ambientais;
- Planejamento ambiental em áreas urbanas e rurais. Prevenção de desastres ambientais;
- Administração, gestão e ordenamento ambientais, licenciamento ambiental, adequação ambiental de empresas;
- Monitoramento ambiental, avaliação de impactos ambientais e ações mitigadoras, controle de poluição ambiental;
- Instalações, equipamentos, componentes da Engenharia Ambiental.

No Curso de Engenharia Ambiental da UniAraguaia, o trabalho de conclusão de curso (TCC) é desenvolvido nos últimos dois semestres. O Trabalho de Conclusão de Curso é uma exigência obrigatória à integralização curricular do acadêmico de graduação da UniAraguaia, sendo acompanhado individualmente por um professor do quadro efetivo da FARA que tenha interesse e afinidade com o tema abordado. Os alunos do Curso de Engenharia Ambiental podem optar entre as seguintes modalidades de trabalho: monografia, produção de artigo científico e projeto didático-pedagógico, seguindo as normas da ABNT. O TCC visa o aprofundamento dos estudos acadêmicos, com estímulo à produção científica, para o aprimoramento das competências de análise, de redação e de crítica científica e de apresentação e divulgação de resultados de estudos superiores.

O Estágio Curricular Supervisionado do curso de Engenharia Ambiental da UniAraguaia é compreendido como uma atividade privilegiada de diálogo crítico com a realidade que articula as atividades de ensino, pesquisa e extensão. Sendo assim, configura-se num espaço formativo e de sensibilização dos estudantes para o atendimento das necessidades humanas, sociais e ambientais, visando preservar os valores éticos e buscando a compreensão e reflexão sobre realidade profissional, à luz dos aportes teóricos estudados, propiciando, assim, autonomia intelectual e o desenvolvimento de habilidades relativas ao desenvolvido durante o curso de Engenharia Ambiental. Trata-se, portanto, de um componente curricular, de caráter teórico-prático, cuja especificidade é proporcionar o contato efetivo do aluno com a escola campo, lócus do futuro exercício profissional.

As disciplinas de Estágio Supervisionado são articuladas com a prática de ensino de todas as disciplinas. O trabalho interdisciplinar tem como objetivo uma articulação das disciplinas, dos procedimentos, dos dados e da organização da pesquisa, a complementaridade dos métodos, dos conceitos, das estruturas que fundam as diversas áreas do conhecimento que compõe o currículo do curso.